Yunan basını, Türkiye ve Yunanistan'ın, Gümrük Birliği Anlaşması Ek Protokolü'nün 2006 yerine 2007'de uygulanması konusunda anlaşmaya vardığını iddia etti. 

Yunan basınında çıkan haberlere göre, Başbakan Recep Tayyip Erdoğan iç siyasette yaşadığı sıkıntılar nedeniyle Yunanistan Başbakanı Kostas Karamanlis'ten, Ankara Anlaşması Ek Protokolü'nü uygulamamak için ricada bulundu ve bir yıl süre istedi. 

Elefterotipia gazetesi konuyu 'Erdoğan'dan Atina'ya: Tutununcaya kadar elimden tutun' başlığıyla sayfalarına taşıdı. 

Erdoğan'ın, Ek Protokolü 2007 yılında uygulama niyetini dile getirdiğini ileri süren Yunan medyası, Karamanlis'in Erdoğan'ın taleplerine sıcak baktığını iddia etti. 

İki başbakanın ayrıca yaz mevsiminde Ege'de gerginliğe sebep olabilecek durumlardan kaçınılmasında da anlaştığı ve genelde Türkiye'nin tek taraflı uyguladığı 1988 tarihli 'yaz aylarında Ege'de askeri tatbikat yapılmaması moratoryumu'nu yeniden gündeme getirdiği iddia edildi. 

Ek Protokol, Türkiye'nin bütün limanlarını Rumlara açmasını öngörüyor.

Türkiye Ek Protokol'ü imzalamıştı 

Türkiye, Gümrük Birliği'nin Kıbrıs Rum yönetimi dahil AB'ye yeni katılan 10 üyeye de uyarlanması için Ankara Anlaşması'nın Ek Protokolü'nü 29 temmuzda imzalamıştı.
Ancak Türkiye, aynı zamanda bir de deklarasyon yayımlayarak, imzanın Kıbrıs Rum kesimini tanıma anlamına gelmediğini ilan etmişti. 

Altı maddeden oluşan 'Türkiye'nin Kıbrıs ile İlgili Deklarasyonu' adlı metin şöyle: 

1. Türkiye, Kıbrıs sorununa siyasi bir çözüm bulunması yönündeki kararlılığını muhafaza etmektedir ve bu yöndeki tutumunu da açıkça ortaya koymuştur. Bu doğrultuda Türkiye, BM Genel Sekreteri'nin iki kesimli yeni bir ortaklık devleti kurulmasını hedefleyen kapsamlı çözüme ulaşma yönündeki çabalarını desteklemeyi sürdürecektir. Adil ve kalıcı bir çözüm, bölgede barışa, istikrara ve uyumlu ilişkilerin tesisine önemli bir katkıda bulunacaktır.
2. İş bu protokolde atıfta bulunulan 'Kıbrıs Cumhuriyeti', 1960'ta kurulan asıl ortaklık devleti değildir. 

3. Türkiye bu nedenle, Kıbrıs Rum makamlarının, hali hazırda olduğu gibi, Kıbrıs'ta sadece ara bölgenin güneyinde otorite, denetim ve yetki icra ettiği ve Kıbrıs Türk halkını temsil etmediği şeklindeki tutumunu sürdürecek ve anılan makamların tasarruflarını buna göre muameleye tabi tutacaktır. 

4. Türkiye bu protokolün imzalanması, onaylanması ve uygulanmasının, protokolde atıfta bulunulan 'Kıbrıs Cumhuriyeti'nin herhangi bir biçimde tanınması anlamına gelmediğini ve Türkiye'nin 1960 Garanti, İttifak ve Kuruluş anlaşmalarından kaynaklanan hak ve mükellefiyetlerini haleldar etmediğini beyan eder. 

5. Türkiye, işbu protokole taraf olmasının Kuzey Kıbrıs Türk Cumhuriyeti ile mevcut ilişkilerini değiştirmeyeceğini teyit eder. 

6. Kapsamlı bir çözüm bulununcaya değin, Türkiye'nin Kıbrıs'a ilişkin tutumu değişmeyecektir. Türkiye, Kıbrıs'ta kapsamlı bir çözüm sonucunda oluşacak yeni ortaklık devleti ile ilişkiler tesis etmeye hazır olduğunu beyan eder.