UEFA Kupası'nda 2. tur kuraları 3 Ekim Salı günü İsviçre'nin Nyon Kenti'nde çekilecek. Kura çekimi öncesi 40 takımın oluşturduğu toplam 5 torbada yer alacak takımlarda belli oldu. Buna göre; temsilcilerimizden Beşiktaş 3. torbadan, Fenerbahçe ise 4. torbadan kura çekimine katılacak.

Torbalardaki takımlar UEFA tarafından belirlenen puan sistemine göre sıra oluşturdular ve en yüksek puanın sahibi olan son UEFA Kupası Şampiyonu İspanyol Sevilla 1. torbanın ilk sırasında yer aldı. Grup kuralarında aynı ülke takımlarıyla aynı torbalarda yer alan takımlar birbirleriyle eşleşmeyecekler.

5 torbadan çekilecek 1'er takımın oluşturacağı 8 grup olacak. 19 Ekim-14 Aralık tarihleri arasında oynanacak maçlar sonucunda gruplarında ilk 3 sırayı alan takımlar bir üst tura yükselecekler. Takımlar gruplarda sadece 4 maç oynayacaklar ve her takım 2 maçını kendi sahasında 2'sini de deplasmanda oynayacak ve 1 haftasını pas geçecek.

Ülkeler ve UEFA Kupası'ndaki temsilcileriyle takımların oluşturduğu torbalar ise şöyle:
"İspanya (4) : Sevilla, Celta Vigo, Espanyol, Osasuna
Hollanda (4) : AZ Alkmaar, Feyenoord, Ajax, Heerenveen
Fransa (4) : Lens, Nancy, PSG, Auxerre
İngiltere (3) : Blackburn Rovers, Newcastle United, Tottenham Hotspur
İtalya (3) : Palermo, Parma, Livorno
Çek Cumhuriyeti (3) : Liberec, Mlada Boleslav, Sparta Prag
Türkiye (2) : Beşiktaş, Fenerbahçe
Almanya (2) : Bayer Leverkusen, Eintracht Frankfurt
Belçika (2) : Zulte Waregem, Clubbe Brugge
İsrail (2) : Hapoel Tel Aviv, Maccabi Haifa
İsviçre (2) : Basel, Grasshoppers
Romanya (2) : Rapid Bükreş, Dinamo Bükreş
Yunanistan (1) : Panathinaikos
Avusturya (1) : Avusturya Wien
Danimarka (1) : OB Odense
İskoçya (1) : Glasgow Rangers
Sırbistan (1) : Partizan
Polonya (1) : Wisla Krakow
Portekiz (1) : Sporting Braga

TORBALAR

1 Torba
Sevilla (İspanya)
Newcastle United (İngiltere)
Panathinaikos (Yunanistan)
Parma (İtalya)
Ajax (Hollanda)
Bayer Leverkusen (Almanya)
Feyenoord (Hollanda)
Auxerre (Fransa)

2.Torba
Clubbe Brugge (Belçika)
FC Basel (İsviçre)
AZ Alkmaar (Hollanda)
Sparta Prag (Çek Cumhuriyeti)
G.Rangers (İskoçya)
Celta Vigo (İspanya)
Paris Saint Germain (Fransa)
Lens (Fransa)

3.Torba
Beşiktaş (TÜRKİYE)
Palermo (İtalya)
Espanyol (İspanya)
Heerenveen (Hollanda)
Partizan (Sırbistan)
Rapid Bükreş (Romanya)
Wisla Krakow (Polonya)
Liberec (Çek Cumhuriyeti)

4.Torba
Fenerbahçe (TÜRKİYE)
Austria Wien (Avusturya)
Hapoel Tel Aviv (İsrail)
Osasuna (İspanya)
Blackburn Rovers (İngiltere)
Grasshoppers (İsviçre)
Dinamo Bükreş (Romanya)
Livorno (İtalya)

5.Torba
Tottenham (İngiltere)
Maccabi Haifa (İsrail)
Sporting Braga (Portekiz)
Nancy (Fransa)
Eintracht Frankfurt (Almanya)
Zulte Waregem (Belçika)
Mlada Boleslav (Çek Cumhuriyeti)
OB Odense (Danimarka)