Kamuoyunda Adnan Hocacı olarak bilinen Bilim Araştırma Vakfı eski başkanı Altuğ Muştak Berker, 2000 yılında Bilim Araştırma davasında basının gücünün kendi çıkarları doğrultusunda kullanıldığını ve buna bir medya grubunun neden olduğunu öne sürerek Meclis'ten yardım istedi. 

Altuğ Muştak Berker, TBMM Dilekçe Komisyonu'na başvurarak yardım istedi. Berker'in başvurusunu değerlendirmeye alan Komisyon, dilekçeyi Adalet Bakanlığı'na havale etti. Bakanlık tarafından yapılan incelemede ise Berker'in de aralarında bulunduğu Bilim Araştırma Vakfı mensupları haklarında çıkar amaçlı suç örgütü kurmak suçundan İstanbul 2. Ağır Ceza Mahkemesinde açılan kamu davasında, bir kısım sanıklar hakkındaki davanın zamanaşımı nedeniyle ortadan kaldırılmasına karar verilmesi üzerine, aynı davada yargılanan sanıklardan Seçim Köse'nin, davanın mühahillerinden olan Ebru Şimşek hakkında iftira suçundan suç duyurusunda bulunduğu, İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığınca açılan kamu davasında ise davanın derdest olduğuna işaret edildi. İncelemede, Berker'in, Ebru Şimşek ile aralarındaki muhtelif davaları gören mahkemelerin Doğan Medya Grubu'na ait gazete ve televizyonlarda yapılan yayınlarla etki altına alınmaya çalışıldığı yönündeki şikayeti üzerine İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığınca başlatılan soruşturmada, yetkisizlik kararıyla konunun Bağcılar Cumhuriyet Başsavcılığına gönderildiğine işaret edildi. 

Adalet Bakanlığı, söz konusu yayınların tedbiren durdurulmasına yönelik talebin hukuki nitelikte olduğuna, ancak şikayetçi Berker'in usul ve yasa hükümleri uyarınca doğrudan görevli ve yetkili mahkemeye başvurması gerektiğini, yargı yetkisi ve takdir hakkına ilişkin konularda bakanlıkça yapılacak bir işlem bulunmadığını vurguladı. 

Bakanlığın bu yanıtının ardından Dilekçe Komisyonu da Berker'in başvurusu hakkında, Dilekçe Hakkının Kullanılmamasına ilişkin Yasa ve TBMM İçtüzüğü gereğince başka bir işlem yapılamayacağını karar verdi.