Ergenekon soruşturması kapsamında gözaltına alınan eski İnönü Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Fatih Hilmioğlu, 2 yıl önce yaptığı bir açıklamasında, hükümete darbeyle gözdağı vermişti.

Eski İnönü Üniversitesi Rektörü Prof. Dr. Hilmioğlu, 30 Nisan 2007 tarihinde üniversitedeki bir açılış sonrasında basın mensuplarına yaptığı açıklamada, o süreçteki Genelkurmay Başkanlığı'nın bildirisini destekleyerek, "Ordu demokrasiye müdahale etmemiştir. Türk ordusu, cumhuriyetimizin kuruluş felsefesine aykırı olan, Türkiye Cumhuriyeti'nin temel niteliklerine karşı davranan bir hükümete karşı müdahale etmiştir" demişti.

Hilmioğlu, hükümetin iktidardan inmesini isteyerek şu eleştirilerde bulunmuştu:
"Siz peki hangi milletin iradesini temsil ediyorsunuz?' Millet size diyor ki 'Artık inin oradan'. Milletini dediği budur. Milletin sesine kulak vermelerini dilerim. Onurlu bir şekilde hükümetten çekilmek varken, bu yolun artık denenmesi, bu yolun izlenmesi demokrasimiz acısından çok doğru bir yoldur. Onursuz bir şekilde indirilmekten çok daha doğru bir yoldur. Demokrasimizin yara almaması için izlenmesi gereken, derhal siyasal iktidarın hükümetten çekilip, hemen erken seçime gitmesidir."

Rektör Hilmioğlu, "Peki yapılacak bir erken seçimde aynı siyasal iktidar tekrar hükümet olursa?" sorusuna ise şu cevabı vermişti:
"Kim gelirse gelsin. Türkiye Cumhuriyeti laiktir, laik kalacaktır. Eğer insanlar, Türkiye Cumhuriyeti'nin Atatürk ile birlikte temelleri atılmış, cumhuriyetin kuruluş felsefesine uyan, uyar, uymayanlara bu millet gereken cevabı verecektir. Devletin çeşitli kurumları da gereken cevabı verecektir. Kim gelirse gelsin. Yüzde 35'le değil, isterse yüzde 95'le gelsin. Onu da söyleyeyim."