Eskişehir’de örgüt üyelerinin yakalanması ardından geniş çaplı araştırmasını sürdüren İzmir Emniyet Müdürlüğü Terörle Mücadele Şubesi ekipleri, bombayı koyan kişinin daha önceden birçok eyleme karışan Nilüfer Şahin olduğunu belirlemelerinin ardından, Şahin’in Karşıyaka’da kaldıgı örgüt evine baskın düzenlendi. Baskında 1.5 litre asit, kablolar, metal borular, tornavida, eldiven, enjektörler, yol ve havalimanı haritaları, ampul ele geçirilmişti.

Bomba uzmanlarının evde saatlerce yaptığı arama ve çalışmalarda ele geçirilen malzemelerden alınan parmak izlerinden MLKP üyesi olduğu belirlenen ve örgütün bombacılarının da daha önceki tarihlerde kiraladıkları örgüt evinde kaldığını tespit etti. Emniyet yetkilileri örgüt evinde detaylı alınan parmak izlerinde 2003 Haziran ayında Star Gazetesi İzmir Temsilciliği’nin bombalanması olayına karışan Sami Özbil (26) ve İbrahim Akmazlar’ın da parmak izi çıktı. Polis, diğer parmak izi çıkan şahısların kimliğini açıklamazken, ev sahibinin, evi kiralayan şahısların örgüt üyesi olduğunu bilmediği öğrenildi. Yetkililer ayrıca, örgüt üyesi bombacılarının evde sürekli kalmadığını ve mobil olarak gelip, eylem planı yaptıktan sonra diğer illere gittiklerini belirledi.