Karayolları Genel Müdürlüğü tarafından yaptırılmakta olan Bozüyük-Mekece Yolu İyileştirme Projesi kapsamında Bozüyük-İnönü İstasyonu arasında mevcut tren yolunun yeni güzergaha alınması çalışmaları nedeniyle bazı tren seferleri iptal edildi.

Buna göre, 6 Ağustos 2007 tarihinde Boğaziçi Ekspresi Ankara-Haydarpaşa-Ankara, Başkent Ekspresi Ankara-Haydarpaşa-Ankara, Doğu Ekspresi Haydarpaşa-Eskişehir arasındaki seferler iptal edildi. Ancak Doğu Ekspresi, Eskişehir-Kars arasındaki seferini yapacak.