YÖK tarafından açıklanan verilere göre Fırat Üniversitesi 2007 yılında yayınladığı 351 bilimsel yayın ile bir önceki yıla göre yaklaşık olarak yüzde 13 oranında geriledi. 

Fırat Üniversitesi, son yıllarda Türk Üniversiteleri arasında yapılan bilimsel sıralamalarda düşmeye devam ediyor. Dünya üniversiteleri arasında yapılan sıralamalarda sonlarda yer alan Fırat Üniversitesi, Türk Üniversiteleri arasında yapılan Bilimsel Yayın sıralamasında da düşüşünü devam ettiriyor. 

Yüksek Öğretim Kurulu tarafından yayınlanan Üniversitelerin Yayın sıralamasında yayınlanan 351 makale ile 18. sıraya geriledi. Öğretim üyesi başına düşen yayın oranı 0.56 ile 35. sıraya gerileyen Fırat Üniversitesi, 2006 yılında 402 yayın ile 13. sırada yer almıştı.